O eletroencefalograma é indicado sempre que há suspeita de algum distúrbio neurológico e/ou a presença de sintomas como convulsões, problemas durante o sono e outros indicativos de problemas no funcionamento do cérebro. O EEG pode ser usado para diagnosticar anormalidades que possam estar por trás de doenças psiquiátricas e neurológicas, transtornos convulsivos, alterações de consciência, quadros de epilepsias, quadros demenciais e encefalopatias. A fotoestimulação intermitente (FEI) pode induzir o surgimento de alterações patológicas não presentes no eletroencefalograma espontâneo.